据统计，东京都过去24小时新增确诊病例最多，达161例。目前，日本47个都道府县只有岩手县未报告确诊病例。另外，“钻石公主”号邮轮确诊的712个病例中死亡12人，644人出院。

据日本厚生劳动省统计，2月18日至4月12日，日本聚合酶链式反应（PCR）检测总数约13.4万份，距首相安倍晋三6日宣布将检测能力增至每日2万份的目标仍有差距。

日本知名建筑公司清水建设13日宣布，一名员工在家隔离期间死亡后才被确诊。清水建设宣布在东京都等7个都道府县的施工全部暂停。12日，爱知县也报告了2例死亡后才确诊的病例。

13日，日本自由民主党国会议员鸠山二郎的一名秘书确诊，这是日本国会相关人员首个确诊病例。随后，日本国会众议院事务局一名职员、国会议员宿舍一名议员家属也被确诊。

日本多家医院还出现了内部感染。其中，永寿综合医院3月20日起有160多名医护人员和患者感染，20名住院患者死亡。中野江古田医院也有92名医护人员和患者感染。此外神户市、富山市、京都市等多地出现医院内部感染情况。

安倍晋三7日宣布东京都和大阪府等7个都道府县进入紧急状态后，其他一些县也相继根据本地情况宣布了“紧急状态”。爱知县、京都府、岐阜县、香川县和石川县先后独自发布了紧急事态宣言或非常事态宣言。