日本是福建省第三大贸易伙伴，二00六年受到“肯定列表制度”等技术性贸易壁垒的影响，福建省对日本贸易仅呈小幅增长。
     
      　　据福州海关统计，二00六年福建省对日本的进出口贸易达八十五点四七亿美元，比上年同期增长百分之三点七八。其中烤鳗出口二点六二亿美元，下降百分之零点七九。
     
      　　福州海关有关人士指出，目前技术性贸易壁垒成为对日出口的主要障碍。日本国内经济持续低迷，农产品、纺织品和服装等普遍处于国际竞争的“比较劣势产业”。日本政府在宏观调控手段乏力的情况下，在对外贸易政策上采取了消极策略，通过日元贬值，增强出口企业的竞争力并设置障碍、抑制进口，保护国内如农产品、纺织品和服装比较劣势产业。
     
      　　中国加入世界贸易组织后，日本对于中国出口设置的关税壁垒及反倾销等非关税壁垒作用弱化，技术壁垒逐渐成为对日出口的最大阻碍。
     
      　　与此同时，日本政府制定了一系列的环境保护法规，形成了对进口产品的“绿色壁垒”，规定进口产品必须达到ISO9000系列标准体系，特别是《提高资源有效利用法实施令修正案》的公布，对电子电器产品的销售数量、环保要求、化学物质使用信息提出多项苛刻要求。
     
      　　此外，日本政府还针对农产品进口制定了《食品中农业化学品残留的肯定列表制度》，其中将农药、添加剂的受限种类由六十三种提高到七百九十八种，进口农产品残留物限量标准增加到原来的二十倍，高达五万多个，将对福建省茶叶、蔬菜、养殖鱼类特别是鳗鱼产品出口产生深远的影响。