在厚生劳动省，提供理论性支持的是拥有医生执照的“医系技官”等人。他们以科学依据和专业知识来制定政策方案。关系到国民生命和健康的技官等职务与政治保持一定的独立性。政治对“医系技官”人事的介入也比较有限。2017年新设的次官级别的“医务技监”职务，由铃木康裕担任了近3年。

在此次的危机应对中，“医系技官”等人的独立性造成行动迟缓。并未尽快根据严重程度区分患者、增加检测人数，而是优先了“担忧医疗系统崩溃”（轻症住院患者持续增加，导致无法应对重症患者）的一贯立场。

“检测结果存在误差，就算是阳性也有8成的人是无症状和轻症患者”，日本厚生劳动省基于这一见解采取的应对措施招致了海外的批评。4月3日，美国驻日本大使馆称，“（日本）难以准确掌握患者的比例”，呼吁美国公民回国。

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