针对此次地震，日本政府于28日晚间8点前在首相官邸召开了以高市首相为总负责人的“紧急灾害对策本部”会议。除高市首相外，赤间防灾担当大臣、小泉防卫大臣、上野厚生劳动大臣、金子国土交通大臣等相关阁僚出席了会议。

会上，高市首相表示：“目前已确认有人身伤亡、建筑物倒塌、道路损坏等大规模灾情。谨向所有受灾民众致以诚挚慰问。”

她进一步指出：“熊本县知事已向自卫队提出灾害派遣请求，自卫队正在以约3600人的规模陆续在灾区开展活动。在这一重大局面下，秉持人命至上的方针，为最大限度减轻灾害损失、确保国民安全，政府必须与地方自治体紧密合作，动员一切力量采取应对措施。”

此外，她对相关阁僚下达指示：“请与自治体紧密协作，尽快掌握整体受灾情况，并彻夜全力投入灾民搜救及灾害应急对策。同时，要利用‘推式支援’将食品、水等必需品以及防中暑用简易冷风机、电源车等切实送到灾民手中，确保良好的避难环境。”

她最后强调：“要做一切能做的事。请以人命为先，全力应对。”

据悉，“紧急灾害对策本部”的设立是自前年能登半岛地震以来的首次。