受低气压等因素影响，从东北到西日本的广大区域大气状态极不稳定，北陆地区出现非常强烈的降雨。在傍晚地震中观测到震度7的熊本县等九州北部地区，预计29日白天因气温上升等因素，大气状态也将变得极不稳定，需注意雷电、龙卷风等强烈阵风及突发强降雨。

熊本等地降低泥石流灾害危险警报等发布标准
针对熊本县熊本地方观测到最大震度7的地震，气象厅和国土交通省认为，地面可能松动，降雨引发泥石流灾害的风险高于平时，因此对摇晃剧烈的熊本县、长崎县及鹿儿岛县的相关自治体，将在一定时期内下调泥石流灾害危险警报等的发布标准。

下调发布标准的对象为：等级4泥石流灾害危险警报、等级3泥石流灾害警报、等级2泥石流灾害注意报。

适用自治体如下：

标准下调至通常70%的地区：熊本县宇城市、冰川町、熊本市、八代市西部、宇土市、美里町、益城町、上天草市、合志市、大津町、西原村、御船町、芦北町、嘉岛町、甲佐町。

此外，下调至通常80%的地区：熊本县八代市东部、水俣市、山鹿市、菊池市、天草市、菊阳町、津奈木町、长崎县南岛原市、鹿儿岛县萨摩川内市、萨摩町、长岛町。

气象厅呼吁摇晃剧烈地区的民众密切关注今后的降雨情况。

富山小矢部市部分区域发布“避难指示”
富山县小矢部市于下午6点40分向北蟹谷地区、东蟹谷地区及津泽地区南部发布了避难指示。

避难指示属于五级警戒级别中的等级4信息，呼吁民众从危险场所撤离。

宫城石卷市5个地区及田代岛发布“老年人等避难”
宫城县石卷市因大雨导致泥石流灾害风险，于下午5点对市内5个地区及田代岛的2316户、5130人发布了“老年人等避难”信息。

该信息属于五级警戒级别中的等级3信息，呼吁老年人及行动不便者等开始避难。