从5月16日到18日的三天内，日本确诊的非输入型甲感病例激增至135个，病例集中出现在兵库县和大阪府，患者年龄从5岁到60岁，多数患者20岁以下。

　　日本文部科学省18日发表消息称，为应对甲感疫情，兵库县与大阪府决定停课或应地方政府要求考虑停课的国公私立学校总计为2664所，其中幼儿园245所、中小学2194所、大学及短期大学60所、专科及各类学校115所，停课时间为一周。

　　首先针对学校采取防控措施是因为，不仅日本最初确诊的非输入型甲感病例是高中学生，而且已确诊的逾百名甲感患者多数为高中学生。尽管日本政府尚未发表此次非输入型甲感疫情的感染源，但多数专家认为来源于海外，患者入关时病毒处于潜伏期而通过海关检疫。

　　专家分析病例多数为高中学生的原因是，他们长时间集体活动在相同的空间，同时活动范围大，因此比中小学生的感染机会多。兵库县的早期患者多数是5月上旬参加校际交流比赛的学校排球队选手。据说美国纽约市的甲感疫情最初也是以高中学生为中心扩散的。

　　日本政府18日上午在首相官邸召开了甲感对策总部会议。会议决定，暂不将政府行动计划所定义的疫情程度从第二阶段的“国内发生早期”提高至第三阶段的“感染扩大、蔓延期”，另一方面会议认为中小学停课可有效防止疫情扩大，将要求有新的确诊患者的地方政府采取停课措施。首相麻生太郎在会上下达指示，要求竭尽全力防止疫区扩大。麻生表示“有很多人及时接受了适当的治疗，正在顺利康复。目前政府尚未考虑一律要求民众避免外出、集会或减少企业活动”，呼吁国民冷静应对。他同时要求有关部门努力做到迅速准确地向国民提供信息，各省厅要和地方政府紧密合作，做好疫情发生地区的流行病学调查。

　　由于采取部分强制防控措施，给兵库县和大阪府的经济和生活造成较大冲击。兵库县知事井户敏三和大阪府知事桥下彻18日相继来到东京同厚生劳动省官员会面，要求中央政府根据实际情况削弱对疫情地区的生活限制，采取灵活的对策，否则疫情地区将面临城市功能瘫痪和极度生活不便。厚生劳动省官员就逐步扩大的疫区生活限制措施表示：“为避免城市功能陷入瘫痪，已商定视情况发展在一周内调整对策。”

　　大阪府率先制定的灵活措施是，发烧门诊病人经简易检查被诊断为阳性时，如果症状轻微，将被要求控制外出，服用抗流感药物“达菲”并家中养病，病情加重时再住院治疗。大阪市立综合医疗中心的隔离病房内目前有甲感患者住院治疗。该中心表示：“患者增加可能导致床位不足。我们认为大阪府政府的轻度患者不必住院的决定是正确的。”

　　日本内阁府18日宣布，鉴于甲感疫情在国内蔓延，将相继在各民营电视台播放首相麻生太郎呼吁日本国民冷静对待甲感的政府公益广告。专家学者呼吁，甲感症状与季节性流感相似，只要及时接受妥善治疗，完全可以痊愈，不必反应过度。