大隅良典认为，如今的日本社会更加重视应用研究，政府的投入也更加偏向于应用研究，忽略了基础研究的重要性。他希望自己的获奖能够让政府和社会更加重视基础研究，并打算利用此次获得的奖金——800万瑞典克朗(约合93万美元)，再加上企业等机构的支持，以某种形式长期为年轻研究人员提供奖学金和研究经费等。

2001年以来获得诺贝尔自然科学奖的日本科学家有16人，仅次于美国。但那些研究成果主要归功于上一辈科学家，可以反映出上世纪八九十年代日本的科技水平。日本媒体称其为“过去的遗产”，而日本的科研现状却不容乐观。

2010年到2014年，日本科研论文数量占全球科研论文数量的比例从2000年到2004年的9.9%下降到6.3%，作为论文影响力指标的论文被引用次数也从9.1%下滑到6.3%。年轻研究人员急功近利现象抬头，小保方晴子造假事件等让日本的科学研究领域蒙羞。

在2016年英国《泰晤士高等教育》排行榜上，曾排名亚洲大学第一位的日本东京大学也滑落至亚洲第4位。近年来日本经济状况恶化，财政负担日益加重，政府拨付给国立大学的预算投入不升反降。2014年度约为1.1万亿日元(约合106亿美元)，比10年前减少了约10%。

2016年度开始的为期5年的日本《第五期科学技术基本计划》将为研发预算投入26万亿日元(约合2506亿美元)，并加大对年轻研究人员的支持力度。但是日本的财政困难将让日本在与其他新兴经济体的科研竞争中心有余而力不足。

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