在２００８年，日本有４人获得诺贝尔物理学奖和化学奖，因此在白皮书中，日本首先高度评价了自己的科技水平，日本基础科学领域的研究在世界上也处于很高水平。不过，在肯定成绩的同时，白皮书也提出了一些缺点和不足，如与很多国家相比，由政府承担的研究经费比例还比较低；对科技研究者起支援作用的相关人才还比较少等等。最后，白皮书的重点放在了如何采取措施，以便进一步提高由国家支持的基础研究的实力上。此外，白皮书还谈到了美国奥巴马政权的“联邦基础科学倍增计划”等其他国家强化基础科学实力的做法。

　　在白皮书中，日本政府还表示，要在本年度的补充预算中为正在进行的世界最先进的３０项研究设立特别基金，每项研究课题都将获得９０亿日元，总额将达到２７００亿日元。