2011年是日本农业政策发生根本动摇的一年。3月11日大地震、海啸和核电站事故沉重打击了粮食主产地之一的日本东北地区，是否加入跨太平洋[6.73 0.75% 股吧 研报]战略经济伙伴协定（TPP）谈判造成了农业改革方向的严重分歧，农业政策走到十字路口。

一月

14日，菅直人内阁重组，鹿野道彦农水大臣留任。

二月

1日，联合国确定“2011国际合作社年”主题为“合作社，让世界更美好”。

5日，国际动物卫生组织宣布日本恢复“无口蹄疫国”。

22日，农户按户收入补贴制度根据2010年米价情况确定水稻农户补贴标准为15.1万日元/公顷。

三月

11日，日本东北地区发生9.0级地震，引发超过10米的海啸，岩手、宫城、福岛地区遭受毁灭性打击，福岛第一核电站发生氢气爆炸。

25日，农水省将加工原料奶补贴单价11.85日元/公斤提高到11.95日元/公斤。

四月

4日，厚生劳动省医药食品卫生审议会决定维持原有的放射性物质暂定标准值。

8日，受福岛核电站事故影响，农水省制订水田土壤放射性物质检出标准，当浓度超过5000贝克勒尔/公斤时禁止种植水稻。

28日，文部科学省原子能损害纠纷审查会制订第一次赔偿方针，政府补偿核污染农产品[11.15 1.64% 股吧 研报]的所有损失。

五月

14日，农水省公布2010年实施“农户收入补偿制度”的补贴面积，其中水田试验面积为1019476公顷，利用闲置水田提高粮食自给率的面积为609427公顷。

31日，文部科学省原子能损害纠纷审查会制订第二次赔偿方针，将政府补偿范围扩大到核辐射影响导致滞销或价格暴跌农产品。

六月

20日，日本国会通过《灾后复兴基本法》，制订灾后重建的基本理念和框架。

七月

1日，农水省批准东京谷物商品交易所和关西商品交易所进行大米期货贸易的申请，认定通过引入“农户收入补偿制度”，扩大了生产调整的选择性，大米期货贸易不会给“生产、流通造成明显壁垒”。 1939年日本实施战时经济管制停止大米期货交易，71年后的首次重开。

八月

3日，农水省公布大米放射性物质调查结果，并制订了大米上市的限制规则，以市町村为单位在水稻收割前后作2次放射性物质检查。

5日，原子能损害纠纷审查会初步掌握福岛第一核电站爆炸事故的灾害损失，制订《赔偿中期方针》，将福岛等17个地区养殖的肉牛列入政府补偿范围。

8日，东京谷物商品交易所和关西商品交易所开始大米期货贸易，其中东京交易所以意想不到的高价订单不断，导致首日没有形成最终价格。

10日，日本农业协同组合中央会举行换届选举，万岁章（新泻中央会会长）接替茂木守当选会长，北海道中央会会长飞田稔章、广岛中央会会长村上光雄当选副会长。

11日，农水省公布2010年以热量为单位的日本农产品自给率为39%，跌破40%关口。主要原因是高温、多雨导致甜菜、小麦减产。

29日，民主党内选举，野田佳彦胜出，他也成为2009年9月民主党上台以来第三任首相。

九月

2日，野田首相成立民主、国民新党联合执政的内阁，小泽派议员多人入阁，鹿野道彦农水大臣留任。

十月

20日，野田首相主持召开了“食品与农业再生实现会议”，正式出台《农业改革基本方针及行动计划》。内容包括增强农业竞争力、促进农业产业化经营、充分利用农业农村资源、灾后重建等七个方面。

24日，万岁章会长向官房长官提交了1167万人反对加入跨太平洋战略经济伙伴关系协定（TPP）谈判的签名目录，向国会提交了350名国会议员（总数722名）签名的请愿书，并举行了大规模的拖拉机游行、集会等活动。

十一月

8日，农协、消费者协会、医疗团体6000人举行第二次反对加入TPP谈判大游行。

13日，野田首相参加APEC首脑会议，宣布日本参加TPP谈判。

30日，农水省政策审议会粮食分会制订2012年大米生产目标为793万吨，比2011年减少2万吨。

十二月

19日，厚生劳动省向内阁府食品安全委员会咨询了放宽美国牛肉进口限制措施，开始研究从原来允许20个月龄以下牛肉进口的条件放宽至30个月龄，同时放宽部位的限制。

22日，厚生劳动省举行食品安全放射性物质专题审议会，提议大幅提高食品放射性物质检出标准，蔬菜、谷物、肉类等一般食品的标准从200贝克勒尔/公斤提高到100贝克勒尔/公斤。

24日，日本政府向国会提交2012年财政预算案，总额为90.3339万亿日元，比2011年减少2.777万亿日元。其中，农业一般会计预算为2.1727万亿日元，比2011年减少4.3%，增加农业灾后重建预算1550亿日元，合计农业预算额为2.3284万亿日元。