日本经贸工业部资源能源厅在2003年对境内各种发电方式的成本做过比较，结论是40年运营期限内，核电的成本效益是水电和燃油发电的两倍。但这个比较是基于私营企业的市场运营成本，完全忽略了日本核电运营的主要资金来源——政府补贴。从1998年开始，每年日本政府在核能上预算额度是5000亿日元左右，其中三分之一是对核电站所在地市政的补贴，还有三分之一是在核能研发上的开销。《三类能源开发法》规定日本每度电的电费里必须包含400日元“电力开发税”，而私营电力企业对核电研发的投资不到政府预算十分之一。

2011年8月，智库“日本经济研究中心”(JCER)判断日本政府从3月福岛事件发生后到当时为止至少补贴东电公司2460亿美元。为支付这笔钱，每度电里向消费者多征了3.7美分的“电力开发税”。2012年5月12日，日本政府决定再向东京电力公司注资一兆日元（1250亿美元），持股75%，东电被彻底国有化。《经济学人》杂志在报道此事的文章中回顾了日本电力行业历史：“从1980年代开始，电力企业就开始不像充满活力的公司了，倒像臃肿蹒跚的政府机构。电力企业的老板们更倾向于做操弄权柄的政客，而非经营实业的商人。”

四分之三的日本公司支持废止核能，受访企业表示向海外转移企业并非有效较少能耗的方式

据路透社5月25日调查，四分之三的日本公司支持废止核能。27%的受访企业表示反对继续开发核能的想法，18%全力支持结束现有核电企业，55%表示只要有合理替代方案就支持全部废核。智库“日生基础研究所”的经济调查室长斋藤太郎认为：“日本企业从去年开始就已经应对核电站纷纷停机下线的状况，现在调查结果如此不令人惊讶。如果愿意的话我们（日本企业）没有核能也能生存，只是在找到替代方案前要暂时依靠火电。”

近十年来，日本有两次长期的成批核电反应堆关闭，但随后两个夏天都没发生电荒

日本2003年东京电力公司的广告称：“现在东京都市区40%的电力来自福岛郡和新泻郡的反应堆。”2003年4月15日，东电旗下17座反应堆因故障全部停机检修。到8月底只有6座反应堆重新开始运转。与预料相反，2003年夏天，东京未曾大规模停电，日用电量只有三天超过550亿瓦（最高时565亿瓦），低于东电估计的645亿瓦日用电量峰值。2011年夏天，日本境内一大半核电站已经因福岛事件关停检修。整个东京如临大敌，闹市区的大屏幕上不断显示整座城市用电量的变化，如果突破红色区域——据媒体说，东京将面临大停电。最终，东京、大阪等可能特别缺电的地方，不仅没有发生电荒，甚至在夏天即将过去时，还出现了一定程度的电力过剩。 [详细]