随着新冠肺炎疫情的爆发，国际航班停飞或减少了班次。部分外国政府宣布暂停了出境团体游，从3月9日开始飞往日本的中韩航班仅降落成田与关西国际机场，都沉重打击了新千岁国际机场。

3月份通过新千岁国际机场出境的外国人减少94%，只有8300人次。日本人的出入境也大幅减少，回国人数减少88%，只有2900人次，出境人数减少92%，只有1800人次。

最近，从新千岁国际机场出发和抵达的国际航线相继停飞。3月份到达新千岁的国内外航空公司的线路减少了84%，只有157个航班。为应对新冠疫情，日本政府宣布从3月上旬开始连接中韩的航线只限定在成田与关西机场降落。在新千岁国际机场，连接韩国首尔的大韩航空以及飞往北京、上海的中国国际航空、中国东方航空等航空公司都停飞了北海道航线。

2019年3月执飞连接俄罗斯等地的包机航线，在2020年3月的实际飞行数为零。（编译：刘戈 校对：陈建军）