报道称，本庶佑与小野药品工业公司共同开发了PD-1抗癌药物Opdivo，双方于2006年签约协议，约定向本庶佑支付专利使用费。据本庶佑和相关人士称，由于专利使用费过低，本庶佑未领取专利使用费，小野药业将专利使用费委托给法务局管理。经国税局判定，该委托金是基于有效的合同，属于本庶佑的收入，并应缴纳相应所得税。据本庶佑方面的相关人士透露，因考虑到继续拒收该专利费将造成应缴纳税金不断增加，计划全额领取后按照要求修改申报材料，缴纳应付税金。本庶佑表示，已委托律师、税务师按照法律处理该专利费用的相关问题。

据悉，本庶佑于2020年6月围绕从美国制药公司获得的专利使用费的分配问题，向大阪地方法院提起诉讼，要求小野药业应向其支付约226亿日元（约合14亿元人民币）专利使用费。本庶佑和美国免疫学家詹姆斯艾利森（James Allison）因“发现负性免疫调节治疗癌症的疗法方面的贡献”，共同获得2018年的诺贝尔生理学或医学奖。