统计显示，东京都3日新增确诊病例12例，福冈县北九州市当日新增确诊病例5例。东京都2日新增确诊34例后，当晚首次发出“东京警报”，提醒民众留意“密闭”“密集”“密切接触”所谓“三密”的高风险环境。

日本厚生劳动省集体感染对策小组成员、北海道大学教授西浦博认为，如果东京都恢复疫情之前的生活方式，有可能在7月中旬之前疫情再次恶化，而且单日新增病例可能达到100例。他呼吁人们减少餐饮业等场所的人际接触，尽量避免“三密”环境。

据日本厚生劳动省3日统计，日本确诊病例中已有14771人出院或者结束隔离，聚合酶链式反应（PCR）检测人数累计超过30万。