这座奥林匹克博物馆位于东京新宿区，在国立竞技场对面，与日本奥委会位于同一座大楼内。由于日本每天仍然有新冠病例确诊，博物馆制定了多条入馆要求，第一，必须首先提前从网站上预约；第二，对观众人数采取限制，每30分钟只能有60人，并且参观时间不能多于1小时；第三，参观线路单向，入口和出口分开，减少观众之间的接触。

自5月25日解除了紧急状态后，日本全国的博物馆已经逐步恢复开放。东京国立博物馆已经于6月2日起开放部分展览设施，不过入馆仍然需要提前预约。