3月1日上午举行的东京马拉松比赛中，日本名将大迫杰以2小时5分29秒获得第四名，打破日本国内纪录和自己在2018年芝加哥马拉松赛上创造的黄种人纪录。他不仅收获日本的第3个东京奥运会马拉松名额，还获得日本国内设置的1亿日元破纪录奖金。埃塞俄比亚选手莱盖塞跑出2小时4分16秒，夺得冠军。

受新冠肺炎疫情影响，本届东马取消大众选手参赛，仅有207位专业选手参加。东京马拉松组委会在2月22日发布道歉声明，对此前“劝退”中国参赛者感到抱歉，承诺保留其参赛名额并免除2021年比赛的报名费。按照东京奥运会田径项目达标体系，每个项目各奥委会最多可报3名达标运动员参赛，目前中国男女马拉松运动员均拿到3个（满额）参赛席位。